No se puede hacer necesariamente una comparación uno a uno. Dojo es una bestia diferente en realidad ... tiene una arquitectura mucho más compleja y, por lo tanto, es fácil de usar, pero con esta compensación, para simplificar, obtienes un framework js mucho más robusto y extensible desde el punto de vista programático.
Personalmente no soy un gran admirador de Dojo ya que normalmente no desarrollo aplicaciones JS como GMail o lo que tengo. Creo que este es el contexto en el que Dojo realmente brilla. Pero si todo lo que necesitas hacer es agregar algunos wigets ui y manipular el DOM creo que jquery es la mejor opción.
Para responder a su pregunta directamente: No, jQuery hace que Dojo sea menos o más necesario. Y en mi opinión, jQuery 1.2.6 era tan maduro como Dojo, y el nivel de madurez de los proyectos nunca ha sido una consideración desde que comencé a usar ZF: siempre ha sido sobre las necesidades del proyecto y cómo/qué funciones se implementan en cada .