Si tiene Visual Studio, también tienen el compilador de C línea de comandos, que Visual Studio invoca cuando se construye su proyecto. Entonces solo tienes que invocarlo desde la línea de comando.
También puede descargar un compilador C gratis, hay una gran cantidad de opciones disponibles, tales como http://gcc.gnu.org/releases.html, o ver http://www.thefreecountry.com/compilers/cpp.shtml
Si asumimos que está utilizando el Microsoft C/C++ Compiler (cl.exe cuales estará en el subdirectorio de VC de su instalación de Visual Studio), abra el símbolo del sistema de Visual Studio (tendrá las rutas correctas establecidas). Para compilar un archivo llamado "helloworld.c", escriba:
cl helloworld.c
Para obtener más información, consulte the MSDN docs.