Estoy obteniendo resultados extraños en mi archivo .tex que no puedo suprimir con <> o sink(). Notablemente, las líneas no deseadas no están encerradas por .. {Schunk} o similar.¿cómo puedo suprimir la salida de Sweave que no está suprimida por echo = FALSE?
Esto ocurre para mí cuando uso DEoptim o rjags, aunque esto probablemente no se limite a estas funciones.
ejemplo archivo .Rnw:
\documentclass[a4paper, 12]{article}
begin{document}
<<echo=FALSE>>=
require(DEoptim)
Rosenbrock <- function(x){ #example from DEoptim authors
x1 <- x[1]
x2 <- x[2]
100 * (x2 - x1 * x1)^2 + (1 - x1)^2
}
lower <- c(-10,-10)
upper <- -lower
set.seed(1234)
DEoptim(Rosenbrock, lower, upper)
@
\end{document}
Lo que quiero que suceda El resultado que me gustaría es el archivo tex que se produciría si la salida fueron suprimidos, o equivalentemente, si el trozo de código se elimina del archivo .Rnw:
\documentclass[a4paper, 12]{article}
\usepackage{Sweave}
\begin{document}
\end{document}
Qué sucede Sin embargo, el archivo resultante tiene .tex salida de la función:
\documentclass[a4paper, 12]{article}
\usepackage{Sweave}
\begin{document}
Iteration: 1 bestvalit: 132.371451 bestmemit: -1.851683 4.543355
Iteration: 2 bestvalit: 8.620563 bestmemit: -1.854371 3.369908
....few hundred lines of DEoptim output ....
$member$storepop
list()
attr(,"class")
[1] "DEoptim"
\end{document}
Tenga en cuenta que la salida no está encerrado por \ begin {Schunk} \ end {} Schunk, por lo que los signos $ confundir LaTeX y ganó' t compilar.
Hola Henrik, eliminé los resultados = tex del fragmento de código. Lo uso en el documento real para usar con xtable(), pero eliminé la tabla del ejemplo. El resultado es el mismo con o sin él. –
He agregado un ejemplo de lo que me gustaría ver: todo el resultado de ejecutar el código suprimido. En el caso de rjags, el resultado es cinco páginas de informes de progreso. –