Para aquellos que tienen este problema con Android Studio. Pruebe lo siguiente:
1) Vaya a su configuración del proyecto
2) Ir a Módulos -> y en la pestaña opción del módulo seleccione "Fuentes" - Debe haber una opción de "Añadir raíz de contenido" y debajo, las carpetas de pestañas azules, verdes y rojas para las carpetas de origen, las carpetas de origen de prueba y las carpetas excluidas, respectivamente.
3) En el lado derecho, haga clic derecho en la carpeta fuente de Java que desea agregar y seleccione para añadirlo a la fuente o pruebas (dependiendo de qué tipo de archivos que va a agregar).
4) Los archivos agregados deberían verse con un círculo azul con una C en el centro del cristal de la ventana de proyecto de la izquierda.
Muchas gracias, lo he comprobado de nuestra subversión. ¿Tienes alguna sugerencia de cómo puedo incluirlos de nuevo? –
Muchas gracias, funcionó bien (en intellij 8 para información) –
Gracias, estoy muy contento de poder ayudar. – duffymo