ClickOnce no tiene ningún soporte de compresión incorporado. Pero puede usar la compresión HTTP en el nivel del servidor web.
Siga estos pasos para habilitar la compresión bajo IIS7:
% windir% \ system32 \ inetsrv \ config \ applicationHost.config (ver mis comentarios, otras líneas son por defecto)
<httpCompression directory="%SystemDrive%\inetpub\temp\IIS Temporary Compressed Files">
<scheme name="gzip" dll="%Windir%\system32\inetsrv\gzip.dll" />
<dynamicTypes>
<add mimeType="text/*" enabled="true" />
<add mimeType="message/*" enabled="true" />
<add mimeType="application/x-javascript" enabled="true" />
<add mimeType="*/*" enabled="false" />
</dynamicTypes>
<staticTypes>
<add mimeType="text/*" enabled="true" />
<add mimeType="message/*" enabled="true" />
<add mimeType="application/x-javascript" enabled="true" />
<add mimeType="application/atom+xml" enabled="true" />
<add mimeType="application/xaml+xml" enabled="true" />
<!--HERE! deploy files-->
<add mimeType="application/octet-stream" enabled="true" />
<!--HERE! application files-->
<add mimeType="application/x-ms-application" enabled="true" />
<!--HERE! manifest files-->
<add mimeType="application/x-ms-manifest" enabled="true" />
<add mimeType="*/*" enabled="false" />
</staticTypes>
</httpCompression>
¿¿Sigue sin funcionar?? Agregue esto al mismo archivo (de manera predeterminada, IIS 7.0 no comprime los archivos a menos que se soliciten "con frecuencia")
<serverRuntime frequentHitTimePeriod="00:00:59" />