error de direccionamiento sys.excepthook en escritura del golpe

Question

He escrito un script bash que está haciendo exactamente lo que yo quiero que haga, pero expulsando el siguiente error:

close failed in file object destructor: sys.excepthook is missing lost sys.stderr

estoy completamente confundido sobre cómo abordar esto. Aquí está el script:

#!/bin/bash 

usage() { echo "${0##*/} inputfile outputfile"; exit 1; } 

(($#==2)) || usage 

INPUTFILE="$1" 
OUTPUTFILE="$2" 

# All that is written between between the 'cat' command and 
#+ 'EOF' will be sent to the output file. 
cat <<EOF >$OUTPUTFILE 
$(date "+Generated on %m/%d/%y at %H:%M:%S") 

DATA AUDIT: $1 

------------ 
COLUMN NAMES 
------------ 

$(csvcut -n $INPUTFILE) 

--------------------------------------- 
FIRST TEN ROWS OF FIRST FIVE COLUMNS 
--------------------------------------- 

$(csvcut -c 1,2,3,4,5 $INPUTFILE | head -n 10) 

------------ 
COLUMN STATS 
------------ 

$(csvcut $INPUTFILE | csvstat) 

---END AUDIT 
EOF 

echo "Audited!" 

Soy bastante nuevo en los scripts de shell y muy nuevo en python. Apreciaría cualquier ayuda.

Answer 1

Estaba viendo este error cuando salía de una secuencia de comandos de Python 2.6.2 en el comando head en bash en Ubuntu 9.04. Añadí try bloques para cerrar stdout y stderr antes de salir de la secuencia de comandos:

try: 
    sys.stdout.close() 
except: 
    pass 
try: 
    sys.stderr.close() 
except: 
    pass 

yo ya no estoy viendo el error.

Answer 2

Supongo que la secuencia de comandos csvcut de Python funciona de otra manera pero está arrojando un error cuando intenta cerrar archivos y salir.

Si, como dices, la secuencia de comandos está funcionando y suponiendo que el error 'csvcut' arroja salidas a stderr, redirigirlo a/dev/null sería una solución temporal.

cat <<EOF >$OUTPUTFILE 2>/dev/null 

Naturalmente, cualquier otro mensaje de error en su heredoc también se redirigirá allí.

Answer 3

hay dos pasos que debe realizar:

Paso 1:

En su csvcut guión, encontrar todos los lugares en los que se llaman sys.stdout.write(), asegúrese sys.stdout.flush() se llama después de cada write().

Paso 2:

Con el paso 1 completado ahora debería ser capaz de capturar IOError dentro de la secuencia de comandos de Python. A continuación se muestra un ejemplo sobre cómo manejar la tubería rota:

try: 
    function_with_sys_stdout_write_call() 
except IOError as e: 
    # one example is broken pipe 
    if e.strerror.lower() == 'broken pipe': 
     exit(0) 
    raise  # other real IOError 

Espero que ayude!