Error de tipo de archivo desconocido con el archivo .pyx

Question

Estoy intentando crear un paquete de Python (pyregion) que contenga un archivo * .pyx y se produce un error durante el proceso de compilación. Revisando el resultado siguiente:

$ python setup.py build 
running build 
running build_py 
creating build 
creating build/lib.macosx-10.5-x86_64-2.7 
.... 
running build_ext 
building 'pyregion._region_filter' extension 
C compiler: gcc -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch x86_64 -DNDEBUG -g -O3 -arch x86_64 

error: unknown file type '.pyx' (from 'src/_region_filter.pyx') 

¿Alguna idea sobre cuál podría ser el problema? Solo para observar, estoy usando la compilación de Enthought de Python (7.1) en OSX con la última versión de Xcode (4.1).

Saludos

Answer 1

El .pyx deben deben compilarse a C con Pyrex y luego compilados a código objeto. Compruebe si hay un archivo src/_region_filter.c presente en la distribución y hackear el script setup.py para compilarlo. (Además, considere filing a bug report, ya que esto no debería estar sucediendo.)

Answer 2

Instale pyrex primero y funcionará.

Haga lo siguiente: sudo pip instalar pyrex

Answer 3

me sale el mismo error utilizando Cython, pero lo resuelve por el cambio

cmdclass = {'build_ext ': build_ext }, 

a

cmdclass = {'build_ext': build_ext }, 

como puedas no aviso, carácter en blanco redundante detrás de 'build_ext '.

Answer 4

Mi propia solución para el mismo mensaje de error que tenía: Cythonize sus *.pyx archivos en el guión setup.py

from distutils.core import setup 
from Cython.Build import cythonize 
... 
cythonised_files = cythonize("src/*.pyx") 

(He intentado instalar Pyrex, pero terminó con errores sobre caracteres no reconocidos en su lugar)

Más detalles aquí: http://docs.cython.org/src/userguide/source_files_and_compilation.html