2012-06-17 14 views
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Estoy escribiendo una función que implica otra función desde la base R con una gran cantidad de argumentos. Por ejemplo (función real es mucho más largo):cómo pasar argumentos a la función dentro de una función en r

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA) { 
matrix <- as.matrix (dataframe) 
out <- heatmap(matrix, Colv = Colv) 
return(out) 
} 

data(mtcars) 

myfunction (mtcars, Colv = NA) 

El mapa de calor tiene muchos argumentos que se pueden pasar a:

heatmap(x, Rowv=NULL, Colv=if(symm)"Rowv" else NULL, 
     distfun = dist, hclustfun = hclust, 
     reorderfun = function(d,w) reorder(d,w), 
     add.expr, symm = FALSE, revC = identical(Colv, "Rowv"), 
     scale=c("row", "column", "none"), na.rm = TRUE, 
     margins = c(5, 5), ColSideColors, RowSideColors, 
     cexRow = 0.2 + 1/log10(nr), cexCol = 0.2 + 1/log10(nc), 
     labRow = NULL, labCol = NULL, main = NULL, 
     xlab = NULL, ylab = NULL, 
     keep.dendro = FALSE, verbose = getOption("verbose"), ...) 

Quiero usar estos argumentos sin enumerarlos en el interior mifuncion.

myfunction (mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) 
Error in myfunction(mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) : 
    unused argument(s) (col = topo.colors(16)) 

He intentado lo siguiente, pero no funcionan:

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA) { 
matrix <- as.matrix (dataframe) 
out <- heatmap(matrix, Colv = Colv, ....) 
return(out) 
} 
data(mtcars) 

myfunction (mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) 

Respuesta

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Trate tres puntos en lugar de cuatro, y añadir el argumento de puntos suspensivos a la función de nivel superior:

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA, ...) { 
    matrix <- as.matrix (dataframe) 
    out <- heatmap(matrix, Colv = Colv, ...) 
    return(out) 
} 
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sólo para añadir una opción (o agregar confusión), puede aumentar el contenido de '...' estableciendo una variable dentro de su función principal 'dotfuns <-list (..., other_variable)' y pasándola a las funciones subsiguientes. Haga esto bajo su propio riesgo :-) –

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@CarlWitthoft lo siento, no pude entender lo que quiere decir, podría agotar su solución (tal vez como respuesta) – jon

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No fue una respuesta a su problema específico, solo un comentario sobre otras cosas que pueden hacerse con la colección '...' de argumentos. –

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