Trama de contorno de matplotlib de Python escala de color logarítmica

Question

Tengo problemas con una trama de contorno que usa escala de color logarítmica. Quiero especificar los niveles a mano. Matplotlib, sin embargo, dibuja la barra de color de una manera extraña: las etiquetas no están bien colocadas y solo aparece un color. La idea se basa en http://adversus.110mb.com/?cat=8

¿Hay alguien por ahí que pueda ayudarme? Yo uso la versión más reciente matplotlib git-repositorio, v1.1.0 (2011-04-21)

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from matplotlib.mlab import bivariate_normal 
from matplotlib.colors import LogNorm 
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages 


delta = 0.5 

x = np.arange(-3.0, 4.001, delta) 
y = np.arange(-4.0, 3.001, delta) 
X, Y = np.meshgrid(x, y) 
Z = bivariate_normal(X, Y, 1.0, 1.0, 0.0, 0.0) 

fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(1,1,1) 
#axim = ax.imshow(Z, norm = LogNorm()) 
axim = ax.contourf(X,Y,Z,levels=[1e0,1e-1,1e-2,1e-3],cmap=plt.cm.jet,norm = LogNorm()) 
cb = fig.colorbar(axim) 

pp = PdfPages('fig.pdf') 
pp.savefig() 
pp.close() 


plt.show() 

muchas gracias por su ayuda! Funciona perfecto, como usted sugiere ... Sin embargo, tengo otra pregunta: ¿Por qué matplotlib no me permite seleccionar el número de líneas de nivel en el modo logarítmico:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from matplotlib.mlab import bivariate_normal 
from matplotlib.colors import LogNorm 
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages 


delta = 0.5 

x = np.arange(-3.0, 4.001, delta) 
y = np.arange(-4.0, 3.001, delta) 
X, Y = np.meshgrid(x, y) 
Z = bivariate_normal(X, Y, 1.0, 1.0, 0.0, 0.0) 

fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(1,1,1) 
#axim = ax.imshow(Z, norm = LogNorm()) 
#axim = ax.contourf(X,Y,Z,levels=[1e-3,1e-2,1e-1,1e0],cmap=plt.cm.jet,norm = LogNorm()) 
axim = ax.contourf(X,Y,Z,20,cmap=plt.cm.jet,norm = LogNorm()) 
cb = fig.colorbar(axim) 

pp = PdfPages('fig.pdf') 
pp.savefig() 
pp.close() 


plt.show() 

http://i.stack.imgur.com/VeVFQ.png

Ésta era mi problema original ...

Answer 1

Por lo tanto, se puede arreglar fácilmente; ¡Su orden de niveles significa que el último nivel se dibuja al final y por lo tanto cubrió todo! Probar:

axim = ax.contourf(X,Y,Z,levels=[1e-3, 1e-2, 1e-1, 1e0],cmap=plt.cm.jet,norm = LogNorm()) 

lugar y usted debe obtener el resultado deseado.

Answer 2

Parece que levels espera que aumenten los valores. Intente cambiarlos a: levels=[1e-3, 1e-2, 1e-1, 1e0] y vea si eso resuelve su problema.